W pomieszczeniach należących do nowojorskiej organizacji pomagającej bezdomnym zostaje odkryty starożytny dokument. Tom Bohannon, szef placówki, jest tym znaleziskiem oszołomiony i zaintrygowany. Zaszyfrowana informacja, spisana na starym pergaminie, pchnie Toma i jego przyjaciół w podróż po całym świecie, obudzi zadawnione spory wśród żydowskich i muzułmańskich wojskowych i postawi cały Bliski Wschód przed groźbą wojny atomowej. Tajemny szyfr to oparta na faktach, zapierająca dech w piersiach opowieść pełna tajemnic i napięcia.