11-letni Joe cierpi z powodu choroby objawiającej się całkowitym brakiem odporności zwykłe przeziębienie mogłoby być dla niego śmiertelnie niebezpieczne. Dlatego żyje w bańce sterylnie czystym szpitalnym pokoju, w którym powietrze jest starannie filtrowane, a funkcje życiowe chłopca stale monitorowane. Odwiedzający go goście i personel szpitala pojawiają się w maskach i kombinezonach.
Jest bardzo samotny rodzice zginęli w wypadku samochodowym, opiekuje się nim starsza, kochająca i lojalna siostra Beth. Również szpitalny personel jest życzliwy dla tego niezwykłego chłopca, który całymi dniami ogląda filmy o superbohaterach i rozmawia na Skypie z innym chłopcem z bańki, Henry'm. Jego życie zmienia się o 180 stopni wraz z pojawieniem się nowego pielęgniarza Amira.
To on rzuca chłopcu wyzwanie, by poznał życie, które istnieje poza szpitalnym reżimem.
Chłopiec z bańki to pełna czułości i ciepła opowieść o tym, by czerpać z życia garściami, niezależnie od okoliczności.